首先，申请人需具备相应的资质条件，包括具有合法的营业执照、符合要求的营业场所和仓储设施、配备专业技术人员等。同时，企业负责人及质量负责人应具备相应资格，并熟悉药品管理法律法规。
其次，申请人需向所在地的药品监督管理部门提交申请材料，主要包括：企业基本情况、营业场所和仓库平面图、质量管理文件、人员资质证明等。相关部门在收到申请后，将对申请材料进行审查，并组织现场检查，确认是否符合法定条件。
通过审查和现场验收后，药品监督管理部门将依法颁发药品经营许可证。获得该证后，企业方可依法开展药品经营活动。同时，企业还需定期接受监管部门的监督检查，确保持续符合相关要求。
此外，药品经营许可证有效期为5年，期满前需按规定办理延续手续。如企业发生变更，如法定代表人、经营范围等，也应及时申请变更登记。
总之，申请药品经营许可证是一项严谨而重要的法律程序，企业应严格遵守相关法律法规，确保药品经营行为合法合规，切实保障公众用药安全与合法权益。