一、准备材料
1. 药品经营许可证正本复印件
2. 企业营业执照副本复印件
3. 法定代表人或负责人身份证明
4. 原药品经营许可证副本丢失的书面说明（需加盖公章）
5. 《药品经营许可证申请表》
6. 其他可能要求的材料，如企业变更记录等
二、提交申请
携带上述材料到当地市场监督管理局或药品监督管理部门提交补办申请。部分地方可能要求通过网上政务平台进行申报。
三、审核与公示
相关部门对提交的材料进行审核，确认无误后，会对企业情况进行核查。若符合条件，将进行公示，接受社会监督。
四、领取新证
经审核通过并完成公示后，企业可前往指定地点领取新的药品经营许可证副本。
五、注意事项
1. 补办过程中应确保所有材料真实有效，不得提供虚假信息。
2. 在许可证补办期间，企业应继续遵守相关法律法规，不得擅自从事药品经营活动。
3. 不同地区可能存在具体操作差异，建议提前咨询当地监管部门。
六、法律依据
药品经营许可证的补办依据《药品管理法》《药品经营质量管理规范》等相关法律法规执行。
总之，药品经营许可证副本丢失后应及时补办，以确保企业合法合规经营。建议企业在办理过程中保持与监管部门的良好沟通，确保流程顺利进行。