在实际操作中，图书经营许可证一般由所在地的**文化和旅游局**或**新闻出版局**负责办理。具体来说，如果是从事图书、期刊、电子出版物等出版物的零售或批发业务，需向当地**出版物发行许可管理部门**申请《出版物经营许可证》。
办理流程大致如下：
1. 准备相关材料，包括企业营业执照、法人身份证明、经营场所证明等；
2. 向当地文化和旅游局或新闻出版局提交申请；
3. 相关部门进行审核，符合条件的将颁发《出版物经营许可证》；
4. 持证后方可合法开展图书经营业务。
需要注意的是，不同地区可能在具体实施细节上略有差异，建议提前咨询当地相关部门，以获取最新、最准确的信息。