保密资质是企业开展涉密业务的前提条件，也是保障国家安全和信息安全的重要手段。根据我国相关法律法规，保密资质的申请和管理主要由国家保密行政主管部门负责。
目前，我国的保密资质主要包括《涉密信息系统集成资质》和《武器装备科研生产单位保密资格》等类型。这些资质的申请和审核工作，均由国家保密局及其下属机构负责。
对于《涉密信息系统集成资质》，申请人需要向省级以上保密行政管理部门提交申请材料，经过审查、现场评审和公示等程序后，由国家保密局或其授权单位颁发资质证书。
而对于《武器装备科研生产单位保密资格》，则由国防科技工业管理部门和地方保密行政管理部门联合组织评审，最终由国家国防科技工业局和国家保密局共同批准。
无论是哪种类型的保密资质，申请人都需要具备相应的人员、技术、设备和管理制度，并通过严格的审查流程。同时，获得资质的企业还需要定期接受监督检查，确保持续符合保密要求。
总之，保密资质的办理部门主要是国家保密局及各级保密行政管理部门。企业在申请前应详细了解相关政策和流程，确保顺利取得资质，合法合规地开展涉密业务。