首先，市政总承包二级资质的申请费用主要包括以下几个方面：
1. **人员费用**：企业需要配备一定数量的专业技术人员，包括注册建造师、工程师、技术负责人等。这些人员的工资、社保、挂靠费用等都是重要的支出。
2. **办公场地费用**：企业需要有固定的办公场所，并提供相关证明材料，部分地方还要求办公面积达到一定标准。
3. **设备费用**：虽然市政二级资质对设备的要求相对较低，但企业仍需具备一定的施工机械设备，或提供设备租赁合同。
4. **资质申报费用**：企业可以选择自行申报，也可以委托第三方机构代办，代办费用一般在几千到上万元不等。
5. **年检与维护费用**：资质取得后，企业每年需要进行年检，确保资质持续有效，这部分费用通常为几百到几千元不等。
6. **其他杂费**：如资料打印、证书制作、公证费用等。
总体来看，市政总承包二级资质的办理和维护总成本大约在1万到5万元之间，具体价格因地区差异和企业自身条件而有所不同。例如，在一线城市，由于人力成本和办公租金较高，费用可能更高；而在二三线城市，费用则相对较低。
此外，企业还可以通过“资质升级”或“联合投标”的方式降低初期投入，比如先申请三级资质，待具备条件后再升级为二级。
总之，市政总承包二级资质的费用涉及多个方面，企业在申请前应做好详细的预算规划，并选择正规渠道办理，以确保资质合法有效，顺利承接工程项目。