首先，营业执照是企业合法经营的基本凭证，由市场监督管理部门核发。它证明了企业具备从事某种经营活动的资格，是企业注册成立后的“身份证”。无论是开餐馆、卖商品还是提供服务，都需要先取得营业执照，才能正式营业。
其次，食品经营许可证是专门针对从事食品销售或餐饮服务的企业而设立的行政许可。该证由市场监管部门或食品药品监管部门颁发，主要目的是确保食品经营者具备基本的食品安全保障能力。申请食品经营许可证需要满足一定的条件，如经营场所符合卫生标准、从业人员具备健康证明、有完善的食品安全管理制度等。
两者的关系是：营业执照是前提，食品经营许可证是补充。没有营业执照，企业无法合法注册；没有食品经营许可证，即使有营业执照，也不能从事食品相关业务。因此，食品行业从业者必须同时办理这两项证件，才能合规经营。
在实际操作中，企业应根据自身经营范围，提前了解相关法律法规，准备好必要的材料，如身份证明、经营场所证明、食品安全管理制度文件等，向相关部门提交申请。同时，还要注意证件的有效期，及时进行年检或续期，避免因证件过期而被处罚。
总之，营业执照和食品经营许可证是保障市场秩序和消费者权益的重要手段，企业应高度重视，依法办理并妥善保管，确保经营活动合法、安全、有序进行。