首先，纳税人资质证明一般由当地税务局出具。企业纳税人可以通过以下几种方式查询或获取：
1. **前往当地税务局窗口办理**：携带相关证件（如营业执照、法人身份证等）到主管税务机关申请开具纳税人资质证明。
2. **通过电子税务局网站或APP办理**：许多地区已经开通了电子税务局服务，纳税人可以登录本地区的电子税务局平台，在“我要办税”或“证明开具”模块中申请开具纳税人资质证明。
3. **拨打12366纳税服务热线咨询**：如果对办理流程不熟悉，可以拨打全国统一的纳税服务热线，咨询具体的办理方式和所需材料。
对于个人纳税人，通常不需要单独开具“纳税人资质证明”，但在某些特殊情况下（如涉及个税申报、退税等），也可以向主管税务机关申请相关证明。
需要注意的是，不同地区的具体操作流程可能略有差异，建议提前通过官方网站或电话了解当地税务局的具体要求。
总之，纳税人资质证明的查询和办理主要依赖于当地税务机关，及时与税务部门沟通是确保顺利获取证明的关键。