首先，公司需要确认哪些资质已经过期。这包括但不限于营业执照、行业许可证、税务登记证、安全生产许可证等。不同类型的公司可能涉及不同的资质证书，因此要根据实际情况逐一核对。
其次，公司应及时联系相关部门或机构，了解资质续期的具体流程和所需材料。通常，续期申请需要提交企业法人身份证明、营业执照副本、相关业务证明材料以及填写完整的申请表等文件。同时，还需要注意是否有年检或年度报告的要求，确保所有手续齐全。
如果资质过期时间较长，可能还需要补交滞纳金或其他费用。因此，公司在处理资质续期时，应提前咨询相关部门，避免因不了解规定而产生额外负担。
此外，公司还应加强内部管理，建立资质有效期提醒机制，避免再次出现资质过期的情况。可以安排专人负责资质管理，定期检查各项资质的有效期，并在到期前一个月左右开始准备续期工作。
如果公司暂时无法办理续期手续，应尽量减少相关业务活动，以免因无证经营受到处罚。同时，可以向相关部门说明情况，争取一定的宽限期或特殊处理。
总之，公司资质过期后，应及时采取措施进行处理，确保合法合规经营。同时，也要从中吸取教训，完善管理制度，防止类似问题再次发生。